Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGMNQ99538 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGMNQ99538 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms