Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms