Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TSKUQ8WUA8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms