Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms