Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00301Q8NCQ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms