Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDXQ7Z353 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms