Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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