Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms