Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FXNQ16595 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FXNQ16595 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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FXNQ16595 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FXNQ16595 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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