Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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