Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRKQ15262 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms