Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHAF1AQ13111 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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