Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms