Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RXRBP28702 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RXRBP28702 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRBP28702 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RXRBP28702 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms