Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB4P28070 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB4P28070 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms