Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMNB1P20700 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms