Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPBP14678 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms