Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC172P0C7W6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms