Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TVP23AA6NH52 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms