Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms