Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms