Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms