Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms