Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms