Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX4Q5JUW0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms