Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LETM2Q2VYF4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms