Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCOLCEQ15113 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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