Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RAB39AQ14964 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB39AQ14964 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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