Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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STX4Q12846 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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STX4Q12846 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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STX4Q12846 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STX4Q12846 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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STX4Q12846 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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STX4Q12846 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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