Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms