Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGSM2O43147 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms