Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms