Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC1

JADE2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2Q9NQC1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JADE2Q9NQC1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms