Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SMIM3Q9BZL3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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