Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms