Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF34Q969K3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF34Q969K3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms