Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3C6Q969F1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms