Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NANOGP8Q6NSW7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NANOGP8Q6NSW7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms