Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MICAQ29983 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MICAQ29983 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MICAQ29983 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MICAQ29983 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms