Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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