Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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