Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.367e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 211.73□□□□□ -0.537e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-211ENST00000505662 1422 ntTSL 325.43■■□□□ 1.661e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.661e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.491e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-225ENST00000635546 1115 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-217ENST00000509864 621 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 514.99□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 SMUG1-222ENST00000514685 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.83■■□□□ 1.891e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-203ENST00000379707 1396 ntTSL 1 (best)20.01■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-201ENST00000379701 1977 ntTSL 210.4□□□□□ -0.741e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 BAG1-204ENST00000467389 1173 ntTSL 510.18□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CENPX-211ENST00000585091 739 ntTSL 324.3■■□□□ 1.489e-7■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.224e-11■■■□□ 15.3
PABPC4Q13310 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 236.74■■■■□ 3.474e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-236ENST00000584991 1862 ntTSL 516.71■□□□□ 0.272e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 516.55■□□□□ 0.242e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 515.81■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-237ENST00000585163 2519 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-217ENST00000580287 2609 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 513.23□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-231ENST00000584063 2759 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-225ENST00000582482 2455 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-211ENST00000578996 566 ntTSL 211.22□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CDK5RAP3-209ENST00000578663 949 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-10■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-10■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CISH-203ENST00000491847 5042 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.152e-10■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.911e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-201ENST00000372849 433 ntTSL 59.04□□□□□ -0.961e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-23■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-39■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-42■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.247e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.817e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 215.83■□□□□ 0.123e-10■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21e-323■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TNNT1-205ENST00000586282 327 ntTSL 56.51□□□□□ -1.373e-13■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.046e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.076e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.166e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.052e-39■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SERF2-215ENST00000475927 692 ntTSL 215.63■□□□□ 0.093e-41■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HBE1-201ENST00000292896 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-323■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 NAA10-202ENST00000370011 538 ntTSL 518.9■□□□□ 0.621e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.391e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TAF10-203ENST00000531760 502 ntTSL 518.91■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.571e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.161e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-21■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.153e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.043e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.624e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.523e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 330.39■■■□□ 2.464e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.443e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.433e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.413e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.383e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.383e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.357e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.243e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.153e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.075e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.025e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CYB561-211ENST00000580691 1127 ntTSL 1 (best)27.55■■■□□ 27e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.924e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.913e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 TCIRG1-211ENST00000530449 525 ntTSL 1 (best)26.34■■□□□ 1.812e-11■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 SLC30A5-204ENST00000504103 382 ntTSL 326.02■■□□□ 1.763e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.73e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.655e-7■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.65e-8■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.577e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.577e-9■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 224.81■■□□□ 1.563e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.493e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.473e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.461e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-217ENST00000457212 905 ntTSL 524.17■■□□□ 1.463e-6■■■□□ 15.2
PABPC4Q13310 FAM3A-210ENST00000426266 936 ntTSL 323.92■■□□□ 1.423e-6■■■□□ 15.2
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