Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF1Q12946 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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