Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms