Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms