Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT1P21579 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT1P21579 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms