Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5AP20339 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms