Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms