Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DQB1P01920 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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