Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP22Q9UPT9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms